基本医疗保险的“三大目录”包括基本医疗保险药品目录、诊疗项目目录、医疗服务设施标准。三大目录并不是一成不变的，是随着社会的发展和人民群众生活水平日益提高的而变化调整提高的。
基本医疗保险药品目录：
是指基本医疗保险、工伤保险和生育保险基金支付参保人员药品费用和强化医疗保险医疗服务管理的政策依据及标准。
诊疗项目目录：
医保定点医疗机构为参保人员提供医疗服务时，临床诊疗，检查，由价格部门制定了收费标准的诊疗项目，由此规范社会基本医疗保险诊疗项目。在实际操作中，通过制定基本医疗保险诊疗项目来确定。
医疗服务设施标准：
在提供住院等医疗服务过程中，应选择必需适量的医疗服务设施和环境作为医疗保险的给付范围。在实际操作中，通过制定基本医疗保险服务设施标准来确定。为规范医疗服务设施范围和支付标准，各省市还制定了相应的办法，确保参保人员基本医疗需求
为保障参保职工的基本医疗用药需求，合理控制医疗费用支出，规范基本医疗保险用药、诊疗等方面的管理，保证基本医疗保险制度的健康运行，国家、省制定了《基本医疗保险药品目录》、《城镇职工基本医疗保险诊疗项目目录》、《城镇职工基本医疗保险医疗服务设施项目范围》，简称“三个目录”。
对照“三个目录”，参保人员患病发生的医疗费用分三类：一类是直接纳入报销范围的费用；另一类是个人首先自负一定比例后再纳入报销范围的费用；第三类是医疗保险不予报销而由个人全部自负的费用。其中使用药品发生的费用，按《基本医疗保险药品目录》分为甲类、乙类两种，不在目录内的药品为自费药品。甲类药品直接纳入报销范围按比例报销；乙类药品个人首先承担费用的10%人体白蛋白等首先负担30%后，再按规定比例报销；自费药品不报销。
使用诊疗项目及服务设施发生的费用，按《城镇职工基本医疗保险诊疗项目目录》及《城镇职工基本医疗保险医疗服务设施项目范围》，分为直接纳入报销范围按比例报销的项目、个人首先自负一定比例后再按比例报销的项目、自费项目三类。直接纳入报销范围的项目按规定比例报销；个人首先自负一定比例后再按比例报销的项目个人首先自负10%、15%后，再按规定比例报销；自费诊疗或服务设施项目不报销。
